Je nach Ausgeprägtheit der Symptome und dem Stadium wird die Lyme-Borreliose durch die Gabe von Antibiotika über 10 Tage bis 4 Wochen behandelt. Auch dann, wenn ein Erythema migrans nicht schmerzhaft ist und die Rötung spontan verschwindet, ist eine Behandlung (10 Tage Doxycyclin) angebracht, damit sich die Krankheit nicht weiter entwickeln kann.
Auch in einem späten Stadium ist die Krankheit in der Regel gut behandelbar, wobei 2 bis 4 Wochen Antibiotika eingenommen werden müssen. Eine längere oder wiederholte Behandlung ist überflüssig und möglicherweise gesundheitsschädlich.
Die Vorbeugung beruht auf Maßnahmen zur Vermeidung von Zeckenbissen (soweit möglich), der Untersuchung des Körpers auf Zecken und deren Entfernung sowie der Erkennung möglicher klinischer Anzeichen. Eine vorbeugende Behandlung mit Antibiotika wird nicht empfohlen.